Reine et régente d’Austrasie, elle est la fille du roi wisigoth Athanagild. Elle épouse, vers 567, le roi franc d’Austrasie Sigebert Ier qui est l’un des petits-fils de Clovis. Sa sœur Galswinthe épouse dans le même temps le roi de Neustrie, Chilpéric Ier, autre petit-fils de Clovis. Frédégonde, qui a été la concubine de Chilpéric, le pousse à assassiner sa propre femme et à tuer également son beau-frère, Sigebert. Brunehaut parvient, enfermée dans Paris, à faire reconnaître pour roi, l’aîné de ses fils, sous le nom de Childebert II. Le lendemain, elle épouse elle-même l’un des fils de Chilpéric, Mérovée.

En 587, elle signe un traité avec Gontran, roi de Bourgogne. L’une des clauses fait de Childebert II son successeur. Mais, coup sur coup, Gontran meurt en 592 et Chidebert II en 595. Brunehaut, au nom de ses petits-fils Théodebert II et Thierry II, administre avec fermeté les royaumes d’Austrasie et de Bourgogne. A la mort de Frédégonde, en 597, Brunehaut prétend étendre son pouvoir sur tout le monde franc, mais l’aristocratie austrasienne comme ses deux petits-fils exaspérés se rallient au roi de Neustrie, Clotaire II, père de Dagobert. En 612, Théodebert II vaincu n’a plus aucun pouvoir ; peut-être même est-il physiquement éliminé. En 613, Clotaire II envahit l’Austrasie. Brunehaut lui est livrée. Il la condamne à mort. Il fait torturer cette femme alors âgée de près de quatre-vingts ans. Puis, il la fait attacher par les cheveux à un cheval sauvage que l’on emballe et qui traîne le corps de Brunehaut jusqu’à l’épuisement. Son cadavre est brûlé. Après cette mort, par un massacre, Clotaire II rétablit l’unité du royaume des Francs que Brunehaut n’a pu accomplir.